E' stato possibile ricostruire la cronologia dei parroci di Santo Stefano solo a partire dall'epoca di San Carlo. Prima di allora si ha notizia di un Tomaso de Orsini, canonico di Santa Maria Assunta di Gallarate, titolare nel 1445 delle cappelle di Santo Stefano e di Santa Maria in Oggiona. Con decreto Vescovile del 2010 la parrocchia viene accorpata a Oggiona, Cavaria e Premezzo, con un unico parroco.